遇到这种情况怎么办？

公司承揽了一个水库的除险加固工程，我是该项目的项目部组成成员。现有列问题向大家求教： 我项目部于2002年10月25日进场，2003年的10月15日全部施工完毕。2004年7月15日，业主组织省水利主管部门进行了土建的4个分部工程的验收，全部被评为优良。2005年6月22日，由业主组织了省水利主管部门进行金属与电气工程共2个分部工程的验收，并组织了整个工程的单位工程的验收。金属与电气分部工程全部评为优良工程，单位工程也被评为优良工程。 讨教1：验收拖延了如此长的时间，作为施工单位有没有权利向业主索赔，有什么依据。 讨教2：在2004年的7月10日，为准备分部工程验收，在有金属与电气两位监理工程师旁站前提下，进行了金属与电气设备的试运行，并达到了设计要求，有二位监理工程师的签字。7月15日的分部工程验收，因省水利主管部门以没有金属与电气验收人员参加为由，不对金属与电气两个分部进行验收。业主也以没有进行分部验收为由，不接受移交。到2005年7月份，应业主要求进行移交，发现有部分电气设备被盗和部分金属设备因无人维护而损坏，致使不能运行。后来由项目部重购买新的零件维修后，得以完善。请问重新修理的费用应由谁负责？